42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0707 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 317 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  64.44 
 
 		 624 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  46.9 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  46.39 
 
 		 337 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  44.71 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  42.12 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  42.12 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  45.64 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  39.73 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  47.37 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  39.58 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  36.46 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  36.46 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  38.1 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  36.46 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 622 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  35.29 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  35.58 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  30.51 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.34 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.41 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.41 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  34.44 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  30.23 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>