46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0200 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 
316 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  90.57 
 
 
318 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  90.88 
 
 
318 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  66.24 
 
 
335 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  51.24 
 
 
318 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  49.65 
 
 
337 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  48.83 
 
 
321 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 
624 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  44.01 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  45.67 
 
 
319 aa  211  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  44.27 
 
 
317 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  38.6 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  43.02 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  41.11 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  38.78 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  38.78 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.83 
 
 
622 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  31.52 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  28.89 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  35.25 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 
331 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  45.12 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  29.48 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  40.24 
 
 
328 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.63 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  36.19 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  30.99 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  41.35 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.25 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  33.64 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  32.8 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  31.71 
 
 
311 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.48 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  30.3 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>