66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0340 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
319 aa  624  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  47.83 
 
 
318 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  47.83 
 
 
318 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  42.21 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  46.71 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  42.36 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  43.69 
 
 
321 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  45.33 
 
 
335 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  39.73 
 
 
317 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 
624 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  43.33 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  43.75 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  39.62 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  42.5 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  40.7 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  37.74 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  38.37 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  38.37 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  26.62 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  31.82 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  25.28 
 
 
622 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  27.24 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  32.59 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  27.98 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  24.54 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.61 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  30.16 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  28.8 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  26.22 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  28.36 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.78 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  24.07 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  26.98 
 
 
137 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  32.04 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  30.29 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  27.17 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.15 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  30.51 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  30.43 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  22.34 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.52 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  27.93 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  22.55 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 
586 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.86 
 
 
342 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
298 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>