60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3013 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
267 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  42.59 
 
 
283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2093  hypothetical protein  41.7 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  41.22 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  36.65 
 
 
297 aa  82  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  34.62 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  38.05 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  34.38 
 
 
333 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.11 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  37.1 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  37.1 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  36.61 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  32.54 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  32.54 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.52 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  37.93 
 
 
624 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.79 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  32.87 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  32.56 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  28.24 
 
 
472 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  34.55 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  37.3 
 
 
327 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  31.69 
 
 
326 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  31.69 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  27.08 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  34.27 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  31.65 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  31.19 
 
 
495 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  34.69 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  27.16 
 
 
318 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  28.93 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  27.54 
 
 
482 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  28.78 
 
 
483 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  28.4 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  29.77 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  35.48 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.72 
 
 
622 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  34.81 
 
 
331 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 
356 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 
356 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  28.35 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
345 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  34.38 
 
 
452 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  32.86 
 
 
321 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>