14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2093 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2093  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  65.87 
 
 
283 aa  333  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  41.7 
 
 
267 aa  149  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  42.11 
 
 
268 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  35.2 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  33.88 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  33.58 
 
 
482 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  36.84 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  29.63 
 
 
495 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  35.48 
 
 
311 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  35.94 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 
472 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>