148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1753 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  100 
 
 		 327 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  63.16 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  67.43 
 
 		 308 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  56.23 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  54.88 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  53.82 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  42.55 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  41 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  42.86 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  42.46 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  38.16 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  39.46 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  39.46 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  43.77 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  41.7 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  37.71 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  40.91 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.03 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  33.5 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.39 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  29.56 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.9 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  31.19 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.43 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  30.32 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  30.54 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  31.48 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  31.48 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  34 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  37.58 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.71 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  32.8 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  32.39 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  33 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  32.39 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  32.39 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  32.39 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.98 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  31.43 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  33.18 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  32.19 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  31.69 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  31.69 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  32.62 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  32.62 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  31.69 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  31.69 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  31.69 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  36.02 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  33.5 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  33.15 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.18 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  34.82 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  31.27 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.65 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.64 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  28.47 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  28.42 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  29.87 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  33.06 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  37.01 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  28.3 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.12 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  35.16 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  32.66 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  30.21 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  24.24 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  30.85 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  30.72 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  32.31 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  30.73 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  31.01 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  33.9 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  32.09 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  29.38 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  30.27 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  36.51 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  34.65 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  30.48 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  24.09 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.32 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  30.48 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  32.86 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  30.27 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>