68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2467 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
342 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  96.49 
 
 
342 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  96.2 
 
 
342 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  82.7 
 
 
318 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  83.33 
 
 
318 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  73.84 
 
 
310 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  52.73 
 
 
326 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  47.54 
 
 
323 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 
322 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  48.74 
 
 
337 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  43.14 
 
 
328 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  46.74 
 
 
304 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  44.95 
 
 
325 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.58 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  45.67 
 
 
326 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  40.42 
 
 
386 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  38.39 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  39.32 
 
 
370 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 
351 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  38.82 
 
 
342 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.25 
 
 
309 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  36.7 
 
 
351 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  41.07 
 
 
351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  39.61 
 
 
314 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  39.18 
 
 
337 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.92 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  38.02 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  38.39 
 
 
320 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  35.81 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  37.71 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  37.41 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
321 aa  132  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  36.25 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.62 
 
 
313 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  35.67 
 
 
338 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.45 
 
 
331 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
307 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  51.49 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.93 
 
 
622 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.84 
 
 
311 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
317 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  30.14 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.48 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  42.22 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.26 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  50 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  31.94 
 
 
354 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.62 
 
 
308 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  31.62 
 
 
308 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.51 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.61 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  30.36 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  28.87 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.87 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.87 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  28.87 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.61 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.95 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  26.46 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  27.84 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  33.33 
 
 
327 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  26.12 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.95 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>