155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 
356 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  69.75 
 
 
359 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  68.83 
 
 
359 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  69.7 
 
 
359 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  76.85 
 
 
357 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  76.54 
 
 
357 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  69.25 
 
 
359 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  69.75 
 
 
357 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  69.54 
 
 
345 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  57.36 
 
 
368 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.76 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  50.31 
 
 
326 aa  272  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  49.68 
 
 
335 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  49.04 
 
 
335 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  48.73 
 
 
328 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  47.5 
 
 
339 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  51.14 
 
 
339 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  47.04 
 
 
325 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  48.95 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  54.27 
 
 
348 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  45.34 
 
 
339 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  47.08 
 
 
325 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  49.06 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  49.54 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  48.59 
 
 
327 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  47.98 
 
 
325 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  57.49 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  47.98 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  49.22 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  47.66 
 
 
325 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  55.99 
 
 
327 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  48.62 
 
 
327 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 
326 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  41.88 
 
 
387 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  51.38 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  45.29 
 
 
369 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  45.29 
 
 
369 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  45 
 
 
369 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  45 
 
 
369 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  45 
 
 
369 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  45.29 
 
 
369 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  45 
 
 
369 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  45.75 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 
363 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  46.67 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  46.29 
 
 
370 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  46.29 
 
 
370 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  46.29 
 
 
370 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  44.38 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  45.99 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  40.16 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  45.99 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 
370 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  45.12 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  43.81 
 
 
363 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  43.8 
 
 
352 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  43.8 
 
 
352 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  44.82 
 
 
399 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 
369 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.01 
 
 
387 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  45.1 
 
 
369 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  47.47 
 
 
327 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  38.74 
 
 
387 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  45.18 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  45.43 
 
 
404 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  43.88 
 
 
392 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 
367 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  50.16 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  45.82 
 
 
354 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  42.15 
 
 
411 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  44.9 
 
 
391 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
376 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  43.15 
 
 
407 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  39.47 
 
 
375 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  41.6 
 
 
406 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  43.49 
 
 
398 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  38.01 
 
 
373 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  42.64 
 
 
506 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  40.36 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  32.1 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.59 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  23.8 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  29.28 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  29.88 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.32 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  34.78 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  31.23 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  26.58 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  27 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.69 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  30.63 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  30.63 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  33.82 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>