More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1411 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  75.1 
 
 		 257 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  75.49 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  73.62 
 
 		 267 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  74.51 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  71.37 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  68.75 
 
 		 242 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  60.63 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  58.04 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  60.33 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  57.48 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  58.66 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  57.87 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  57.48 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  59.84 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  57.25 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  58.66 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  57.09 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  56.69 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  55.12 
 
 		 264 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  53.01 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  54.33 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  52.92 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  52.92 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  51.36 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  52.61 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  45.12 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  52.24 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  49.01 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  51.19 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  49.41 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  52.16 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  51.38 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  48.81 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  51.43 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  51.02 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  40.62 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  49.02 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  51.12 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  43.75 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.83 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  38.98 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  41.04 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  36.86 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.33 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.67 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  35.86 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  39.08 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  37.05 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.56 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.6 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.65 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.65 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.46 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  35.57 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  37.05 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  36.8 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.19 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  39.32 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  35.29 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.1 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  33.76 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36.05 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  37.8 
 
 		 212 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  36.91 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  37 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.39 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  38.57 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  36.8 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  38.24 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  34.75 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  37.77 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.13 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35.56 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.74 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.85 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  34.18 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.84 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.69 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  37.07 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  35.27 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.74 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  38.84 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  35.69 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  32.08 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  38.04 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  36.18 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.61 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  37.67 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.05 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>