More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0947 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  65.4 
 
 
241 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  47.2 
 
 
255 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  44.35 
 
 
263 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  43.37 
 
 
253 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  40.96 
 
 
272 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  39.34 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  40.26 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  41.67 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  38.26 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  37.35 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  40.74 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  45.34 
 
 
259 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.43 
 
 
264 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.43 
 
 
264 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  42.39 
 
 
252 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  38.75 
 
 
267 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  38.26 
 
 
251 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  41.6 
 
 
252 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  38.91 
 
 
267 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  42.36 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  38.49 
 
 
256 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  41.41 
 
 
264 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  40.65 
 
 
252 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  35.1 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  36.67 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  41.3 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  42.21 
 
 
259 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  40.62 
 
 
255 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  35.25 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  39.68 
 
 
268 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  34.73 
 
 
256 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  37.02 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.4 
 
 
274 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  37.6 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  32.95 
 
 
293 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  35.37 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  38.24 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  37.83 
 
 
253 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  35.22 
 
 
256 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 
257 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  38.27 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.4 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  40.65 
 
 
274 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  39.9 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  38 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  37.7 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  39.34 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.4 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  35.11 
 
 
270 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.4 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.23 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  37.98 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  38.27 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  37.4 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  39.33 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  36.4 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  38.55 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  37.35 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  36.4 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  37.86 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.6 
 
 
243 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37.55 
 
 
252 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.2 
 
 
243 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.2 
 
 
243 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.2 
 
 
243 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.2 
 
 
243 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  35.22 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  37.2 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  35.9 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.88 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  40.26 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.6 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  35.09 
 
 
224 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  34.85 
 
 
253 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  39.3 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  38.19 
 
 
247 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  36.95 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  38.17 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  30.51 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  38.7 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  37.21 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.6 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  34.65 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  39.22 
 
 
229 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.32 
 
 
242 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  41.18 
 
 
244 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  32.82 
 
 
272 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  35.5 
 
 
265 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.36 
 
 
279 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  37.8 
 
 
261 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 
272 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.94 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  33.33 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>