More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2712 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  55.69 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  53.44 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  53.39 
 
 
255 aa  260  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  51.03 
 
 
249 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  45.95 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  48.16 
 
 
253 aa  235  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  45.27 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  40.96 
 
 
256 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.02 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  38.4 
 
 
253 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  37.22 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35.85 
 
 
266 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.98 
 
 
266 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  36.68 
 
 
277 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  35.69 
 
 
272 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  37.8 
 
 
273 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.84 
 
 
264 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.88 
 
 
267 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  36.97 
 
 
263 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.47 
 
 
264 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  36.14 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  33.59 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  37.8 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.24 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  38.43 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  34.39 
 
 
268 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.22 
 
 
244 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  37.6 
 
 
272 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  30.71 
 
 
293 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  37.28 
 
 
252 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  37.23 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.91 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.55 
 
 
255 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  36.4 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.64 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  32.22 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  33.77 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  35.59 
 
 
254 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.86 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.44 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  31.93 
 
 
275 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.44 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.18 
 
 
224 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.44 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  34.04 
 
 
242 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  32.41 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  35.08 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.07 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.89 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  34.75 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  32.13 
 
 
272 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  31.73 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  34.35 
 
 
223 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.02 
 
 
271 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  35.16 
 
 
271 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.1 
 
 
263 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  36.02 
 
 
255 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  30.11 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  30.11 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  30.11 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  33.46 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  30.11 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  32.08 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.11 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  29.06 
 
 
263 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.14 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  32.4 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  33.72 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  34.31 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  34.35 
 
 
241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  30.11 
 
 
272 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  29.59 
 
 
272 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.59 
 
 
272 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.98 
 
 
242 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  34.62 
 
 
246 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.74 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  33.73 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  32.95 
 
 
240 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  34.52 
 
 
255 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  33.9 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  34.05 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  33.61 
 
 
244 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  31.01 
 
 
244 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.32 
 
 
246 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  31.45 
 
 
246 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  34.19 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>