More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3397 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  99.62 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  65.79 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  60.75 
 
 		 266 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  60.38 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  60.23 
 
 		 265 aa  334  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  60 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  52.09 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  37.6 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  42.35 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.02 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  39.08 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  37.65 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  40.24 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  40.73 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  35.95 
 
 		 275 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.12 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  35.6 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  41.42 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  36.4 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  40.93 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  36.25 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  34.18 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  35.41 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  35.41 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.41 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  41.08 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  35.02 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  35.02 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.43 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.02 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  40.08 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  34.24 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.68 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.24 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  38.33 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  33.59 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  34.63 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  39.31 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  36.15 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  36.78 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.98 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  39.09 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  36.59 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  34.38 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  35.92 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  40.16 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  37.39 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  37.3 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  35.36 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  37.55 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  33.46 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36.86 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  38 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  31.54 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  36.54 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.04 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.6 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.6 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.04 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.04 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  36.67 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.68 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.04 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  30.99 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  38.65 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  34.57 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  30.27 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  37.84 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  33.47 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  35.46 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  38.66 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.22 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  37.11 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  36 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  40.16 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.93 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.51 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  34.94 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  32.92 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  33.46 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.82 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>