More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0177 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  38.52 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  38.85 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  39.26 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 
267 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.68 
 
 
264 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.68 
 
 
264 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  39.26 
 
 
266 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.3 
 
 
265 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  36.25 
 
 
270 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  34.6 
 
 
271 aa  151  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  40.99 
 
 
283 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  40.99 
 
 
265 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 
253 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  42.98 
 
 
264 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  41.89 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  40.99 
 
 
265 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  40.17 
 
 
277 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.94 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  40.79 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  40.82 
 
 
252 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  37.3 
 
 
272 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.52 
 
 
279 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  30.15 
 
 
272 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.15 
 
 
272 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  31.43 
 
 
269 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.31 
 
 
263 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.37 
 
 
274 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  40.85 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.34 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  39.59 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.45 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  29.77 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  29.77 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.53 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.77 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  40.81 
 
 
276 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  40.09 
 
 
255 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  34.44 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  32.93 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  29.39 
 
 
272 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  29.39 
 
 
272 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  39.91 
 
 
255 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  40 
 
 
255 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  41.44 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  39.59 
 
 
252 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  37.76 
 
 
259 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  29.39 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  40.54 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.39 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  35.56 
 
 
272 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.86 
 
 
293 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  33.73 
 
 
273 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  39.13 
 
 
255 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.61 
 
 
263 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  41.7 
 
 
267 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  38.7 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  39.46 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  37.45 
 
 
275 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  40.36 
 
 
256 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  39.57 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  37.82 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  40.81 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  39.46 
 
 
258 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  34.53 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  39.56 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  40.81 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  38.72 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  30.87 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  35.71 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.96 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  32.39 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  38.63 
 
 
254 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  38.29 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.1 
 
 
244 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  36.4 
 
 
256 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  42.86 
 
 
273 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  36.21 
 
 
256 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  38.5 
 
 
248 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.39 
 
 
244 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  36.26 
 
 
282 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 
273 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.95 
 
 
263 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.91 
 
 
255 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  37.83 
 
 
248 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  38.6 
 
 
265 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.84 
 
 
240 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  31.33 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  31.84 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  37.23 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  36.18 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  33.18 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  35.92 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  36.93 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  36.89 
 
 
246 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>