More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2651 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  67.45 
 
 		 255 aa  341  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  66.53 
 
 		 250 aa  337  8e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  67.59 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  66.53 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  66.53 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  64.17 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  58.51 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  56.02 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  57.26 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  58.09 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  57.68 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  54.58 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  57.26 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  56.07 
 
 		 259 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  53.33 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  53.75 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  51.45 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  51.45 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  52.92 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  53.15 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  53.11 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  53.75 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  52.16 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.47 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  52.36 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  53.15 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  50.59 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  53.15 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  51.38 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  50.39 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  50.99 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  49.8 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  48.81 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  49.59 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  52.05 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  47.66 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  45.38 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  49.79 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  37.07 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  46.34 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.51 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  39.09 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  38.14 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  39.41 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  36.08 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.25 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.55 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.46 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.25 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.11 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  34.1 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.4 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.3 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  41.4 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.12 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.51 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  38.2 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.19 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.84 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.01 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.57 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  40.17 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  37.45 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.69 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.57 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  39.15 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  36.17 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.08 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.29 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.65 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  41.15 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  37.67 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.01 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  37.18 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  38.46 
 
 		 254 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.01 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  38.6 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  39.63 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  40 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  38.66 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  40.71 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  36.63 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  36.75 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.9 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>