More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1763 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  73.86 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  73.86 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  74.79 
 
 		 256 aa  374  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  75 
 
 		 257 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  73.86 
 
 		 256 aa  362  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  68.75 
 
 		 258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  64.05 
 
 		 255 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  63.07 
 
 		 255 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  64.05 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  62.66 
 
 		 256 aa  296  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  61.41 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  63.07 
 
 		 264 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  63.07 
 
 		 259 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  57.68 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  61 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  60.58 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  60.25 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  60.17 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  60.58 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  58.92 
 
 		 276 aa  278  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  59 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  56.85 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  56.85 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  55.79 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.41 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.6 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.75 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.06 
 
 		 263 aa  232  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  53.11 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  56.61 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  51.48 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  56.61 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  55.79 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  52.48 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  51.67 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  48.56 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.26 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  38.93 
 
 		 278 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.83 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  46.06 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.38 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  40.33 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.45 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  41.74 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.43 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  41.33 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.76 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  40.69 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  38.17 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.93 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.94 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  38.59 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  38.59 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.57 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  39.83 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  40.26 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.92 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.91 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  40.27 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.82 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.55 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.29 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.27 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  40.44 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.94 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  40.97 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  40.97 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  40.97 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  40.43 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  38.29 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.69 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  39.39 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.74 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  37.79 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  38.18 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.59 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  34.32 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.03 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  39.74 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.03 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.12 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.71 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  35.06 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.71 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  36.09 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  38.53 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>