More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4772 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  62.45 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  64.2 
 
 		 253 aa  268  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  57.32 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  56.9 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  53.94 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  57.32 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  52.82 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  54.33 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  56.85 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  53.91 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  55.65 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  55.33 
 
 		 242 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  53.53 
 
 		 276 aa  244  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  53.56 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  51.97 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  51.97 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  54.13 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.61 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  52.57 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  49.6 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  49.02 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  49.17 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  52.05 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  50.83 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  48.76 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  49.02 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  52.8 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  48.75 
 
 		 265 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  48.4 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  48.64 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  55.02 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  48.24 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  52.19 
 
 		 273 aa  204  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  41 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  39.43 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  46.37 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  48.95 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  48.57 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.72 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.72 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  33.76 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  39.83 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.1 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.51 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.14 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.92 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.05 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  41.36 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  30.3 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.53 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.91 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.59 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  29.87 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  39.38 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.09 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.33 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  37.69 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  40.36 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  40.28 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  37.84 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  37.96 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  43.46 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.19 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  36.86 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.27 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.92 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  36.32 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.17 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  38.8 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  35.91 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.06 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  31.49 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  37 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  32.9 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  34.04 
 
 		 243 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.65 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.34 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  38.63 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  38.46 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  32.64 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.62 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>