More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2111 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  77.83 
 
 		 238 aa  349  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  73.01 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  60.34 
 
 		 241 aa  258  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  57.02 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  56.3 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  52.3 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  55.46 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  52.23 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  49.13 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  52.65 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  53.16 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  48.26 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.33 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  47.39 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  51.98 
 
 		 255 aa  188  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  48.66 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  52.23 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  51.32 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  48.91 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  48.91 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  48.91 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  50.43 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  50 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  48.92 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  55.46 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  46.75 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  46.12 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  47.76 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  42.79 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  43.69 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  43.24 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  43.36 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  43.69 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  43.38 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  43.24 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.6 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  42.51 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.6 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  40.81 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  38.96 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  41.52 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  44.54 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  42.11 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  38.72 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  41.95 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.78 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  41.18 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  39.29 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  35.22 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  42.41 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  33.95 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.98 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.2 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.16 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  41.26 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.16 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38.16 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  32.19 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  40.64 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.72 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  38.29 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  38.3 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  28.76 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.72 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.89 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  39.46 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  37.87 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.91 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  40.89 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.17 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  38.26 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  36.03 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  38.57 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  38.84 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  43.3 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.28 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  33.19 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.33 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  35.96 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.33 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  40.25 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  39.29 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  35.74 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  30.94 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  35.32 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>