More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2502 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  88.98 
 
 		 256 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  74.9 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  74.51 
 
 		 258 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  73.23 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  72.33 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  73.86 
 
 		 242 aa  362  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  60.63 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  57.87 
 
 		 255 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  58.59 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  56.47 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  56.69 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  57.48 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  56.3 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  56.3 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  56.69 
 
 		 259 aa  277  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  55.16 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  57.32 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  57.44 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  56.3 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  56.38 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  54.51 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  50.97 
 
 		 283 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  50.97 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.4 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  51.68 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  45.06 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  52.36 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  52.36 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  50.59 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  53.47 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  53.94 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  48.83 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  48.82 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.05 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  49.02 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  51.87 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  51.45 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  38.4 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  45.27 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.42 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.06 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.34 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.17 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  41.26 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  44.95 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.42 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  41.42 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.38 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.36 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.48 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.83 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.71 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.48 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.9 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  38.72 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.56 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.94 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.35 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.7 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.74 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  40.39 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  34.67 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  39.56 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.86 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.79 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  35.39 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.75 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.71 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  34.4 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  37.65 
 
 		 285 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.82 
 
 		 272 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  37.8 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  38.33 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.89 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  36.99 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  36.99 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  36.99 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.74 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  36.99 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  36.99 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  41.1 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>