More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3271 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  62.45 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  57.54 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.69 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  52.76 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  53.33 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  54.39 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  53.97 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  53.69 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  51.78 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  52.61 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  53.14 
 
 		 255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  50.59 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  49.42 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  51.56 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  49.42 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  51.97 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  51.48 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  49.03 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  51.02 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  50.81 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  49.8 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  52.46 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  50.78 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  53.53 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  53.14 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  51.45 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  50.62 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  48.44 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  53.82 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  43.21 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  47.84 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  47.06 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  46.67 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  47.24 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  50.21 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  48.32 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  50.21 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  42 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  44.71 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.79 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.29 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40.38 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.04 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  40 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.74 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  32.24 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.11 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  32.37 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.61 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.82 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  37.93 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  42.62 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  39.82 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.96 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  39.45 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  36.08 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  39.83 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  39.83 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  39.83 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.39 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.53 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  35.94 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36.05 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  33.19 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  32.91 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.6 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  33.19 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  31.78 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  36.74 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  38.14 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  33.06 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  33.6 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.9 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.06 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  37.29 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.73 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  31.17 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  32.66 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  33.06 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  32.66 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.58 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  28.34 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  37.7 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  36.44 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  32.9 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>