More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0672 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  52.16 
 
 
258 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  48.82 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  50.39 
 
 
256 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  51.78 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  52.38 
 
 
255 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  51.19 
 
 
255 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  51.17 
 
 
264 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  234  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  50.4 
 
 
255 aa  234  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  50.4 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  50.59 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  50.59 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  50.79 
 
 
267 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  49.21 
 
 
255 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  49.4 
 
 
256 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  50.79 
 
 
255 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  47.66 
 
 
283 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  47.35 
 
 
265 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  50.83 
 
 
242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  47.66 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  48.47 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  45.59 
 
 
265 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  50.39 
 
 
248 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.19 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  41.73 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  47.86 
 
 
254 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  45.38 
 
 
252 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  45.1 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  47.95 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  48.98 
 
 
257 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  47.54 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  49.43 
 
 
253 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  45.24 
 
 
252 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  42.56 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  44.21 
 
 
273 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  33.73 
 
 
278 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  42.23 
 
 
255 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.53 
 
 
223 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  37.13 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.13 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  36.75 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.31 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  39.23 
 
 
212 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  38.7 
 
 
246 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.19 
 
 
246 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  36.86 
 
 
263 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.17 
 
 
279 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  36.26 
 
 
244 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.6 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  42.46 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.25 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  41.15 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.66 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.71 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.5 
 
 
242 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  40.51 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  40.88 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.51 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  38.49 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  33.59 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.63 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  38.19 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  38.06 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  36.12 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.96 
 
 
267 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  36.33 
 
 
243 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.98 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.11 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  36.46 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  38.96 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.84 
 
 
240 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.2 
 
 
242 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  33.62 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  37.85 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.14 
 
 
240 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  36.52 
 
 
243 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  36.52 
 
 
243 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  34.73 
 
 
244 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.86 
 
 
234 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.48 
 
 
263 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  36.52 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  39.39 
 
 
259 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  39.5 
 
 
252 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  41.36 
 
 
259 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  37.83 
 
 
243 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  30.92 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  37.6 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  36.71 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  34.43 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  35.42 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.02 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>