More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3013 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  76.29 
 
 
253 aa  347  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  64.81 
 
 
234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  61.04 
 
 
230 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  61.04 
 
 
230 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  61.04 
 
 
230 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  62.56 
 
 
228 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  59.21 
 
 
229 aa  261  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  60.52 
 
 
250 aa  251  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  57.94 
 
 
236 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  58.62 
 
 
243 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  54.69 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  48.71 
 
 
238 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  49.33 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  48.68 
 
 
228 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  48.26 
 
 
238 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  45.41 
 
 
239 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  47.58 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  48.51 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  46.05 
 
 
227 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  45.85 
 
 
244 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.64 
 
 
255 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  44.77 
 
 
274 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  46.09 
 
 
241 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  44.84 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  39.39 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.93 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  40.81 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  40.81 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.43 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.43 
 
 
246 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.17 
 
 
243 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  36.17 
 
 
232 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.67 
 
 
223 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  41.2 
 
 
243 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.03 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.15 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  39.82 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  41.78 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.29 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.24 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  38.3 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.34 
 
 
242 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  37.82 
 
 
248 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  37.29 
 
 
242 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  44.02 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  42.19 
 
 
250 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  43.72 
 
 
251 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  39.26 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.22 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  41.23 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  39.67 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  36.33 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  37.45 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  37.45 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  41.7 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  38.33 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.03 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  37.02 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  39.64 
 
 
256 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.83 
 
 
241 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.12 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.34 
 
 
246 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  37.02 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.76 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  39.3 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  34.05 
 
 
321 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.44 
 
 
254 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  38.2 
 
 
241 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  41.2 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  33.48 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  36.93 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  34.96 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  38.17 
 
 
279 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  34.76 
 
 
241 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.34 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  36.13 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.68 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.34 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.68 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.04 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  36.14 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  38.89 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.68 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.71 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  38.29 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  38.74 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.68 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  37.34 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  36.44 
 
 
263 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>