More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12179 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  75.44 
 
 
229 aa  331  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  72.77 
 
 
236 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  61.11 
 
 
253 aa  280  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  60.52 
 
 
252 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  61.8 
 
 
234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  57.52 
 
 
228 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  56.96 
 
 
255 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  57.51 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  54.02 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
238 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  50.43 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
228 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  46.29 
 
 
239 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  46.61 
 
 
249 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  46.29 
 
 
224 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  46.05 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.54 
 
 
244 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  51.08 
 
 
241 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  48.58 
 
 
229 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  41.13 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  45.76 
 
 
274 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.64 
 
 
255 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  47.39 
 
 
251 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  43.06 
 
 
235 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  43.75 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  39.58 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  38.3 
 
 
232 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  42.32 
 
 
243 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  38.82 
 
 
253 aa  141  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.85 
 
 
246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  42.74 
 
 
261 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  36.91 
 
 
248 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  37 
 
 
233 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  39.77 
 
 
276 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  38.72 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.26 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  46.95 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.36 
 
 
223 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.15 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.14 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.74 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  44.58 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.89 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  40.17 
 
 
243 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  40.17 
 
 
243 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  38.63 
 
 
243 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  38.24 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  33.63 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  38.72 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.33 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.18 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  41.18 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  39.32 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  37.92 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.02 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.79 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.93 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  31.6 
 
 
224 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  34.66 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  38.82 
 
 
241 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.77 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  39.04 
 
 
264 aa  128  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  41.25 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  35.54 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  39.58 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  37.92 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.08 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  34.01 
 
 
253 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  35.74 
 
 
262 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  37.72 
 
 
253 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  38.26 
 
 
283 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  30.43 
 
 
229 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  37.76 
 
 
239 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 
255 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  31.67 
 
 
270 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  34.85 
 
 
254 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  36.67 
 
 
242 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  36.25 
 
 
259 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  39.29 
 
 
254 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37.93 
 
 
252 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.47 
 
 
248 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  37.55 
 
 
242 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.45 
 
 
266 aa  121  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>