More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5093 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  64.57 
 
 		 227 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  51.98 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  50.44 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  51.98 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  52.23 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  52.25 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  48.23 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  48 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  47.58 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.88 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  49.12 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  48.03 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  44.78 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  44.78 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  44.78 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  50.24 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.29 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  48.9 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  43.61 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  45.61 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.26 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  46.7 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  44.2 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  47.25 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  42.6 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  48.44 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  45.37 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  42.54 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  42.41 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  43.61 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  38.7 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.42 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  45.58 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  41.15 
 
 		 246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.89 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.71 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.38 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  42.48 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.59 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  35.02 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.5 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  41.81 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  41.92 
 
 		 271 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.48 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  36.77 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.82 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  41.23 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  38.1 
 
 		 251 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  38.89 
 
 		 285 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  41.59 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 		 274 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.35 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  41.35 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  39.53 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  34.92 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  34.92 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  38.94 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.22 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.03 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.54 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.54 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  34.96 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.33 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.84 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  36.67 
 
 		 321 aa  121  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  37.33 
 
 		 326 aa  121  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  34.03 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  38.5 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  39.75 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.61 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  38.34 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  39.55 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.05 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  39.13 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  43.11 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  33.77 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  37.93 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.04 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>