More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3195 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  55.46 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  52.38 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  50.43 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  51.29 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  51.74 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  51.42 
 
 		 283 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  48.71 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  50.22 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  51.94 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  47.46 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  48.66 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  50.89 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  50.89 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  50.89 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  49.38 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  48.44 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  48.23 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  55.31 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  54.08 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  46.09 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  49.56 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  46.78 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  46.3 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  48.91 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  50.87 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  45.2 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  47.14 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  47.3 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  43.36 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  48.89 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  31.11 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  47.85 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  42.79 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  41.42 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  36.68 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.76 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  39.83 
 
 		 264 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  44.17 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  40.54 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  45.53 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  40.5 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.68 
 
 		 326 aa  128  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  33.91 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  31.91 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.44 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  39.64 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  42.92 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  39.34 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.87 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.87 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  43.75 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  41.48 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.97 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  39.83 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.97 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  36.97 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.66 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.71 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40.08 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.76 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  37.75 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  34.82 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  38.14 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.76 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.13 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  37.34 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  37.08 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  37.08 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  41.34 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  31.8 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  37.08 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  31.8 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  35.27 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  34.98 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.59 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.66 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  37.83 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  38.08 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.97 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  39.46 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  39.75 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  32.77 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  40.85 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  35.06 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  40.64 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>