More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3291 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  81.57 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  71.09 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  69.65 
 
 		 255 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  68.48 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  68.48 
 
 		 255 aa  342  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  60.7 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  64.05 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  58.27 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  60.47 
 
 		 256 aa  295  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  58.04 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  59.22 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  56.03 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  55.69 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  59.22 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  60.58 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  57.87 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  57.87 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  62.14 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  59.34 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  56.47 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  59.67 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  56.3 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  60.08 
 
 		 276 aa  277  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  56.38 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  54.76 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  51.57 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  56.35 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  55.95 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  54.32 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.91 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  49.81 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  52.16 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  51.81 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  56.85 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  55.08 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  51.56 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  55 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  49.21 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  38.31 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  50.42 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.34 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.51 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  39.35 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  41.89 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  38.64 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  40.62 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  44.91 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.66 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  37.78 
 
 		 285 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.8 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  41.32 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  42.6 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  43.78 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  43.46 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.2 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  42.22 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  41.77 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.27 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.4 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  40.08 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  42.15 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  39.24 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  40.68 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  38.1 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.61 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.61 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.37 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.53 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  39.67 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  41 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  37.74 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  41.74 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  40.52 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.13 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.61 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  41.13 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  40.68 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  34.13 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  39 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  34.32 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  42.39 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.6 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  35.83 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.46 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  41.81 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  38.14 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.9 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  37.14 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.45 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.46 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.72 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  40.25 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.14 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  36.22 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.11 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>