More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2260 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  58.27 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  59.75 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  57.54 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  56.69 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  57.68 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  60.66 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  55.91 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  59.09 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  56.35 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  58.26 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  57.68 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  58.09 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  57.68 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  55.16 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  57.79 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  54.94 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  55.6 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  53.75 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  54.55 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  53.57 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  56.43 
 
 		 265 aa  268  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  53.01 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  56.33 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  56.02 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  51.98 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  53.52 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  53.75 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  51.04 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  54.69 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  54.33 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  53.73 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  52.82 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  52.46 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  48.58 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  52.23 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  48.97 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  47.64 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  39.84 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  41.98 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.53 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  40.97 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  42.04 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  44.7 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  40.45 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.82 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.18 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.18 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.18 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  39.58 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.82 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  37.98 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.77 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  39.04 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.02 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.15 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.29 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  40.81 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.04 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.74 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.03 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  35.86 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  38.99 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.22 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  38.93 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  39.66 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  37.93 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.74 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  32.68 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  32.68 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.06 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  39.3 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.55 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.93 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.57 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.58 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.27 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.9 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  36.76 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  34.11 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.97 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  38.67 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>