More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4166 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  89.76 
 
 		 255 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  81.18 
 
 		 257 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  73.62 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  74.02 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  73.23 
 
 		 256 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  73.86 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  61.81 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  62.1 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  58.98 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  61.89 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  58.2 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  57.81 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  57.2 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  58.2 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  57.87 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  61.48 
 
 		 264 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  56.03 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  60.91 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  60.49 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  56.35 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  57.14 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  56.85 
 
 		 283 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  56.85 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  56.3 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  57.09 
 
 		 248 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  52.76 
 
 		 252 aa  245  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.59 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  47.11 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.6 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.15 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  54.92 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  51.17 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  52.24 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  51.97 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.39 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  54.36 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  55.37 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.79 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  37.2 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  47.52 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  41.52 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.91 
 
 		 246 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.22 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.62 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.67 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  38.84 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.7 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.26 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.46 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  36.8 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  41.7 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.75 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.73 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.95 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.34 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.57 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  37.15 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  41.26 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.65 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.04 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.47 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.24 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.83 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  39.82 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40.17 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  31.3 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  40.35 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  41.7 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  41.33 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  36.26 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.09 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  38.99 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.76 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.02 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  33.04 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.79 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  38.58 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  39.92 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.8 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  37.87 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.07 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.07 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.59 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  38.33 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>