More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0706 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  51.54 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  48.22 
 
 
277 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  47.93 
 
 
275 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  45.78 
 
 
268 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  42.07 
 
 
279 aa  231  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.46 
 
 
268 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  44.13 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  44.86 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  42.47 
 
 
270 aa  211  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  40.29 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  40.15 
 
 
293 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  42.68 
 
 
267 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  44.35 
 
 
269 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  42.41 
 
 
272 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  40.15 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  40.15 
 
 
272 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  40.15 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  40.15 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  40.15 
 
 
272 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  40.15 
 
 
272 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  36.9 
 
 
275 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.15 
 
 
272 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.08 
 
 
272 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  40.08 
 
 
272 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  44.4 
 
 
272 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.77 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  39.23 
 
 
271 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  39.43 
 
 
266 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  43.03 
 
 
274 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  38.06 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  37.6 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.6 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  37.5 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  36.03 
 
 
256 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.47 
 
 
249 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.83 
 
 
263 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  40.89 
 
 
252 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  40.96 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  39.92 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  40.24 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  39.26 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  39.68 
 
 
263 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  35.69 
 
 
256 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.78 
 
 
255 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  38.75 
 
 
224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  35.97 
 
 
253 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  35.18 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  34.81 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  36.08 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  36.23 
 
 
299 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  34.8 
 
 
251 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 
256 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  37.9 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 
260 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.15 
 
 
259 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  33.59 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  38.75 
 
 
254 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  30.38 
 
 
315 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  30.71 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  34.13 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  32.05 
 
 
240 aa  133  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.9 
 
 
242 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.13 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.33 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1271  hypothetical protein  30.33 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000727761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1246  hypothetical protein  30.33 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000369455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  33.84 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  34.98 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.13 
 
 
264 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  32.7 
 
 
255 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  32.7 
 
 
255 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  35.14 
 
 
264 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.95 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.95 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  31.75 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  30.47 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.95 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 
241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.95 
 
 
243 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.95 
 
 
243 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  29.12 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.95 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  31.56 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  30.58 
 
 
282 aa  119  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  32.83 
 
 
259 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  34.57 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  31.56 
 
 
232 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  33.04 
 
 
267 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  34.25 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>