More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0213 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  547  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  46.95 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  36.23 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  38.49 
 
 
279 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  36.08 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  33.58 
 
 
264 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.85 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  36.36 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  32.18 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  31.64 
 
 
277 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  32.43 
 
 
253 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
273 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  33.85 
 
 
275 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2437  protein of unknown function DUF152  35.22 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000259762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  34.9 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  29.67 
 
 
258 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  34.35 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  32.74 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  29.6 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  32.69 
 
 
271 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  28.46 
 
 
255 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  34.23 
 
 
259 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  29.8 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  30.47 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  28.29 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  32.4 
 
 
240 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  29.8 
 
 
243 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  29.8 
 
 
243 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  29.8 
 
 
243 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  30.08 
 
 
243 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  31.79 
 
 
252 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  31.79 
 
 
252 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  29.83 
 
 
261 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  28.85 
 
 
249 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  33.85 
 
 
256 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  34.39 
 
 
248 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  31.79 
 
 
270 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  32.97 
 
 
263 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  28.74 
 
 
243 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  32.12 
 
 
243 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  33.7 
 
 
294 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  30.74 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  27.6 
 
 
257 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  31.02 
 
 
244 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  29.61 
 
 
232 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  35.08 
 
 
224 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  34.76 
 
 
262 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  29.74 
 
 
285 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  31.13 
 
 
252 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  29.03 
 
 
255 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  27.31 
 
 
267 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  32.14 
 
 
254 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  29.34 
 
 
266 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  28.88 
 
 
285 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  32.5 
 
 
274 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  32.34 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  36.81 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  31.86 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1100  conserved hypothetical protein (DUF152 domain protein)  31.41 
 
 
226 aa  99.4  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  31.51 
 
 
234 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  29.57 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.5 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  29.53 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  32.5 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  30.71 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  31.71 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  29.81 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  27.46 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  26.52 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  31.51 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  27.46 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  28.79 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  27.46 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  31 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  28.57 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  26.5 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  27.39 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  27.42 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  29.33 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  27.63 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  31.12 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  25.53 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  31.79 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.79 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  33.52 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>