More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1100 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1100  conserved hypothetical protein (DUF152 domain protein)  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0513  hypothetical protein  54.63 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000314436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1230  hypothetical protein  55.26 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00011378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1352  hypothetical protein  54.82 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  41.24 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  29.83 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  28.88 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  32.04 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  36.61 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.52 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  35.47 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  32.54 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  29.83 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  32.62 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  32.46 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  26.78 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  26.78 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  26.78 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  31.41 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  32.5 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  31.82 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  32.81 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  27.47 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  28.96 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  32.69 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  27.46 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.86 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.25 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  26.78 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  29.03 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  30.53 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  24.39 
 
 		 285 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  27.32 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  34.04 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  26.23 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.31 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  27.32 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  28.18 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  23.27 
 
 		 279 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  29.12 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  29.12 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  30.18 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  26.88 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  26.78 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  27.03 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  23.9 
 
 		 285 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  25.97 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  27.33 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  27.23 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  26.11 
 
 		 256 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  29.79 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  23.66 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  29.59 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  26.52 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  24.08 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  28.57 
 
 		 243 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  27.37 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  27.59 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  30.65 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  26.34 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  25.27 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  24.23 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  23.35 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  26.78 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  27.96 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  27.96 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  28.02 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  26.06 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  31.28 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  28.74 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  22.5 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  28.02 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  22.06 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  23.98 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  25.41 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  25.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  27.62 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  25.53 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  27.27 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>