More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2888 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  56.22 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  53.44 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  53.04 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  49.8 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  48.77 
 
 		 249 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  44.58 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  43.44 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  42.02 
 
 		 259 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  38.84 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  36.96 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.66 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  38.55 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  35.88 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  37.02 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  35.22 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  38.24 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  36.93 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.74 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  37.8 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  35.16 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.9 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  33.59 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  36.68 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  32.95 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.02 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  35.08 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.92 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.13 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.82 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.32 
 
 		 232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  33.08 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.37 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  34.21 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.87 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  34.21 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  32.97 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  30.61 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.84 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  35.06 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.62 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  34.54 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  34.77 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  33.47 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  34.77 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34.82 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  35.32 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.73 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  34.31 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  35.91 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  34.41 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  35.16 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  35.16 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  35.16 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  35.16 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  35.16 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  34.05 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  34.01 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  32.77 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  33.48 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  33.21 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  32.81 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  34.58 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  33.64 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  35 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  30.8 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  32.27 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.75 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  34.63 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  34.01 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.44 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.07 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>