More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0668 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  65.37 
 
 		 257 aa  344  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  62.98 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  64.12 
 
 		 262 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  63.36 
 
 		 262 aa  334  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  65.57 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  65.57 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  65.57 
 
 		 244 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  65.16 
 
 		 244 aa  322  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  64.63 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  54.94 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  57.31 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  57.63 
 
 		 243 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  57.63 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  57.63 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  57.63 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  57.2 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  56.12 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  54.29 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  56.78 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  55.08 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  55.51 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  54.85 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  54.81 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  54.81 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  54.81 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  55.08 
 
 		 243 aa  261  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  54.76 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  50.97 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  51.04 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  50.21 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  51.87 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  55.7 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  51.04 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  51.88 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  51.65 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  47.74 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  49.17 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  48.76 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  49.17 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  51.68 
 
 		 248 aa  234  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  49.37 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  49.38 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  47.7 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  48.43 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  47.54 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  48.73 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  47.74 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  48.32 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  47.74 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  47.11 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  49.03 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  48.76 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  47.08 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  51.25 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  48.76 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  47.5 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  47.95 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  46.31 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  47.95 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  43.85 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  43.85 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  43.88 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  43.9 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  43.51 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  45.93 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  49.37 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  43.82 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  47.56 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  47.41 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  49.37 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1590  protein of unknown function DUF152  45.74 
 
 		 269 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840086  normal  0.0159691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  46.64 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  47.21 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  43.98 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  43.51 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  42.53 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  46.53 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  45.32 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  42.34 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  43.27 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  44.74 
 
 		 266 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  44.15 
 
 		 279 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  44.74 
 
 		 278 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  45.49 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  45.49 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  45.49 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  45.49 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  45.49 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1918  protein of unknown function DUF152  44.96 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396331  normal  0.0287676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  45.91 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  43.49 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  43.87 
 
 		 275 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>