More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0476 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  40.74 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  33.59 
 
 
273 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  31.54 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  32.05 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  32.24 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  31.54 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.94 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  33.61 
 
 
275 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.5 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  31.97 
 
 
299 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  31.85 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  29.07 
 
 
268 aa  128  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.47 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  30.87 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.98 
 
 
239 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.49 
 
 
244 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  38.81 
 
 
229 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  34.96 
 
 
283 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  34.87 
 
 
233 aa  121  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  27.97 
 
 
277 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  30.13 
 
 
244 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  31.4 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  33.92 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  31.63 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  31.12 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  31.86 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.24 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  30.16 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.8 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  31.28 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  28.43 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  30.52 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  33.02 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.12 
 
 
272 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  28.87 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  29.46 
 
 
229 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  29.92 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0938  protein of unknown function DUF152  31.91 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  29.72 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.72 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  28.63 
 
 
252 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.72 
 
 
272 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  28.57 
 
 
252 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  32.4 
 
 
266 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1100  conserved hypothetical protein (DUF152 domain protein)  36.61 
 
 
226 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  29.32 
 
 
253 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  31.65 
 
 
256 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  29.75 
 
 
249 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  27.67 
 
 
255 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  35.53 
 
 
234 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
253 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  29.32 
 
 
269 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  30.7 
 
 
270 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  28.45 
 
 
259 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  27.19 
 
 
275 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  27.42 
 
 
252 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  35 
 
 
315 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  30.41 
 
 
247 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  28.35 
 
 
259 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  31.84 
 
 
272 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  26.92 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  34.65 
 
 
234 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1240  protein of unknown function DUF152  28.1 
 
 
237 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  29.17 
 
 
228 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  30.12 
 
 
248 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  31.05 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  27.57 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  29.68 
 
 
224 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  30.67 
 
 
272 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  30.19 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  32.27 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  27.46 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  28.32 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  27.73 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  26.89 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  30.7 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  31.65 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>