More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5255 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  81.57 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  69.92 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  69.65 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  67.7 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  67.32 
 
 		 255 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  61.09 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  64.05 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  59.22 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  57.2 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  56.69 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  58.89 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  57.25 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  56.08 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  58.59 
 
 		 256 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  56.52 
 
 		 283 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  56.52 
 
 		 265 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  60.49 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  59.75 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  58.51 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  55.73 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  56.38 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  56.85 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  57.2 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  54.92 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  47.74 
 
 		 263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  51.19 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  50.97 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.21 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.15 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  53.97 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  53.97 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  49.61 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  53.33 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.17 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  48.44 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  51.19 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  52.8 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  38.85 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  45.83 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  41.28 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  40.93 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  43.78 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  43.39 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  43.39 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  38.89 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.56 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  42.56 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  37.41 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  37.55 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.58 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.5 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.83 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  40.08 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  38.1 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  43.16 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  40.33 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  37.87 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  41.74 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  37.87 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  38.43 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.09 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  42.67 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  42.08 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.83 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  39.36 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  39.26 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  41.7 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.45 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  37.71 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  40.08 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.98 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  38.34 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.08 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  34.6 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  40.85 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.92 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.11 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.97 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.92 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  38.33 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  37.04 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  35.94 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  36.93 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.89 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  37.85 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.32 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  38.61 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  36.11 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>