More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1574 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  470  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  65.96 
 
 
229 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  49.55 
 
 
249 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  45.78 
 
 
244 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  47.04 
 
 
273 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  43.57 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  46.12 
 
 
238 aa  161  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  46.45 
 
 
261 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  45.87 
 
 
238 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  47.25 
 
 
224 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  46.19 
 
 
231 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  45.62 
 
 
227 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  41.15 
 
 
283 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  44.29 
 
 
230 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  44.29 
 
 
230 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  44.29 
 
 
230 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  42.01 
 
 
229 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  43.95 
 
 
228 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.55 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  40.74 
 
 
253 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.08 
 
 
255 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  40.43 
 
 
246 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 
239 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  46.3 
 
 
243 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  41.94 
 
 
250 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  41.9 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  46.3 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.89 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  40.09 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  41.18 
 
 
236 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  42.45 
 
 
251 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  38.6 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  30.16 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  37.96 
 
 
240 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  33.19 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  33.18 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  31.02 
 
 
229 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  38.26 
 
 
263 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  40.64 
 
 
254 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  39.53 
 
 
241 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  37.79 
 
 
246 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  39.82 
 
 
260 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  35.74 
 
 
311 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  36.82 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.79 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.79 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  33.78 
 
 
248 aa  98.2  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  38.6 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  33.59 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  32.58 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  37.66 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  33.59 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  30.38 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  32.29 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  33.47 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  36.41 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  36.55 
 
 
269 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  36.52 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  36.52 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.01 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  36.52 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  36.52 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  36.52 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  36.17 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  36.52 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  35.02 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  36.41 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1128  hypothetical protein  33.46 
 
 
321 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  36.52 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.08 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  34.56 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  25.42 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  37.79 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  37 
 
 
264 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  34.1 
 
 
229 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  92  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  35.89 
 
 
254 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  36.07 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  33.64 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.75 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  36.09 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>