More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  100 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  55.87 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  53.56 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  48.33 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  48.35 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.64 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  51.01 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  48.32 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  46.67 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  46.29 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  45.26 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.92 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  43.67 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  43.64 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.17 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  44.49 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  43.04 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  42.37 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  42.37 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  43.33 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  42.37 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  44.92 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  34.15 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  43.53 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.08 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  46.19 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  38.98 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  32.67 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  47.53 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  45.34 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  43.64 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  39.35 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  41.32 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  45.2 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.23 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  31.93 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  44.87 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  47.95 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  41.92 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  41.15 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  38.6 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  41.03 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  39.82 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  40.97 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  37.6 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  46.25 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.22 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  38.72 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  37.97 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.37 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  39.91 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  38.59 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.34 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  40.09 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  40.09 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  38.08 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  38.98 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  36.73 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  39.04 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  40.6 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  37.4 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  38.8 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  39.02 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  38.39 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  37.96 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  32.61 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.25 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.27 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  36.97 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.78 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  36.97 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  37.76 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  36.97 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.4 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.84 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  37.85 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  39.76 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  37.61 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.08 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  36.44 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  35.22 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.13 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  31.4 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  39.82 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  30.71 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.92 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  41.25 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  31.74 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.14 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.25 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>