More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1352 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1352  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1230  hypothetical protein  98.23 
 
 
226 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00011378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0513  hypothetical protein  95.58 
 
 
226 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000314436  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1100  conserved hypothetical protein (DUF152 domain protein)  54.82 
 
 
226 aa  239  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  26.73 
 
 
229 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  27.51 
 
 
241 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  26.74 
 
 
239 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  34.44 
 
 
229 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  27.22 
 
 
236 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  28.65 
 
 
253 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  29.51 
 
 
252 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  26.72 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  28.42 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  28.34 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  32.26 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  36.56 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  29.03 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  27.42 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  27.42 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  27.42 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.96 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  25 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  34.36 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  23.78 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  33.16 
 
 
248 aa  87  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  25.41 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  26.49 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  32.04 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  26.13 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  26.74 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  28.65 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  27.17 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  24.86 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  27.42 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  27.51 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  28.7 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  26.44 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  30.11 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  30.05 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  26.6 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  26.88 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  23.76 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  29.59 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  25.98 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  25.26 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  25.62 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  30.73 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  26.46 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  22.6 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  21.63 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  22.84 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  26.7 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  24.34 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  27.03 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  27.46 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  27.84 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  22.12 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  24.86 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  27.42 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  25.27 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  21.14 
 
 
279 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  26.04 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  27.03 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  27.46 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  25.67 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  24.47 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  22.98 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  25.63 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  27.23 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  24.77 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  24.73 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  26.83 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  27.57 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  27.75 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  27.66 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  26.29 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  26.7 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  26.63 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  26.63 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  24.88 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  23.59 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  22.8 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  24.32 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  23.91 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  28.65 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  25.68 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>