More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1256 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  641    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1128  hypothetical protein  70.62 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1571  hypothetical protein  42.9 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0167434  hitchhiker  0.00710721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  34.81 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  33.08 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.31 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.87 
 
 		 243 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.87 
 
 		 243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.51 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  33.07 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.87 
 
 		 243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.87 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.53 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.6 
 
 		 243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  35.51 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  35.51 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  31.84 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  32.58 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  33.08 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  31.06 
 
 		 243 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.16 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.16 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.16 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.16 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.16 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  31.37 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  30.71 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 251 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  30.48 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  32.93 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  33.6 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.15 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  34.12 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  33.85 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  33.2 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  33.2 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  31.18 
 
 		 264 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  34.68 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  29.55 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  34.41 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  31.73 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  32.66 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  31.4 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  32.81 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  35.08 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  35.86 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  32.39 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  30.71 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  31.6 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  31.45 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  30.19 
 
 		 255 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  29.41 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  32.17 
 
 		 279 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  32 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  32.54 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.66 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  29.96 
 
 		 242 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  32.14 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.74 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  29.96 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.1 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  29.37 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  32.67 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  29.92 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  33.6 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.79 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.79 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  30.38 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  33.47 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  30.22 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  28.26 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  32.57 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  30.8 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  32.57 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  32.95 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  31.2 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  28.96 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  30.45 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  31.43 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  34.12 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>