More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2883 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  97.65 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  92.16 
 
 		 255 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  81.64 
 
 		 259 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  68.48 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  67.7 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  60.94 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  63.9 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  61.41 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  57.81 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  61.41 
 
 		 276 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  57.48 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  61.41 
 
 		 256 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  56.69 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  60.17 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  59.84 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  57.26 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  56.3 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  54.72 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  54.36 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  54.15 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  54.55 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  54.15 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  54.58 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  49.17 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  55.83 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  56.02 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  50.59 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  54.32 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  57.08 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  56.67 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.01 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  53.97 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  56.9 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  53.57 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  53.75 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  51.68 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  40.78 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  41.1 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.69 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40.41 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.64 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.84 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  38.65 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.97 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.25 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.84 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.27 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.57 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.4 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.86 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.7 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  38.15 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  38.68 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  35.37 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.63 
 
 		 240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.61 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.3 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  32.95 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.95 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.86 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  38.4 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  38.82 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.9 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  35.29 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.97 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.93 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  37.85 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40.17 
 
 		 223 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.95 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.79 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  41.18 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  38.15 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  35.83 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.56 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  36.6 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  36.11 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.65 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  39.65 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  36.4 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  35.74 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  34.84 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.74 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  32.92 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  35.77 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  39.57 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.19 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.88 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  31.98 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  36.51 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>