More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0911 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  52.4 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  44.53 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  42.07 
 
 
272 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  42.8 
 
 
273 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  41.39 
 
 
293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  37.63 
 
 
277 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  36.47 
 
 
275 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.55 
 
 
268 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.84 
 
 
268 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  38.52 
 
 
253 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  39.51 
 
 
269 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  37.87 
 
 
270 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.27 
 
 
272 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  38.68 
 
 
272 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.86 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  36.63 
 
 
272 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.63 
 
 
272 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.58 
 
 
266 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  37.45 
 
 
269 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.34 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.17 
 
 
274 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  38.02 
 
 
272 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  39.75 
 
 
267 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.65 
 
 
263 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  36.63 
 
 
264 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  35.88 
 
 
272 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.98 
 
 
264 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.98 
 
 
264 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
259 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  38.49 
 
 
266 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  34.6 
 
 
263 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  35.48 
 
 
272 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  31.76 
 
 
315 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  36.1 
 
 
259 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  33.46 
 
 
256 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  35.92 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.1 
 
 
244 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.1 
 
 
252 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  35.27 
 
 
263 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  33.72 
 
 
240 aa  146  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  33.46 
 
 
248 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  35.68 
 
 
252 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  34.52 
 
 
260 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  34.82 
 
 
256 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  35.65 
 
 
254 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.47 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  35.5 
 
 
264 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  32.3 
 
 
251 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  31.82 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  36.51 
 
 
252 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  35.59 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.9 
 
 
265 aa  131  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.9 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  33.85 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  33.9 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  34.6 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  32.41 
 
 
262 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  33.06 
 
 
259 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  33.75 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  32.9 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  35.5 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  31.74 
 
 
255 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  32.9 
 
 
264 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  31.15 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  34.85 
 
 
254 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2437  protein of unknown function DUF152  35.05 
 
 
249 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000259762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1271  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000727761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1246  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000369455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
241 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  30.35 
 
 
249 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  32.77 
 
 
255 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  32.13 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  32.03 
 
 
276 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  32.2 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  32.08 
 
 
258 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.16 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.16 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08900  hypothetical protein  31.54 
 
 
280 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000429341  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  33.62 
 
 
255 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  32.08 
 
 
233 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  32.33 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09450  hypothetical protein  28.88 
 
 
304 aa  112  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000208595  normal  0.0474468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>