More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3434 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  80.83 
 
 		 266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  68.68 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  61.51 
 
 		 267 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  60 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  59.62 
 
 		 264 aa  328  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  60.38 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  41.32 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  39.43 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  43.39 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  42.86 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  37.07 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  42.44 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  36.12 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.21 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  39.22 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  38.06 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  38.02 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  41.67 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.27 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  37.04 
 
 		 299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  43.28 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  35.79 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.35 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  35.85 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  35 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  38.43 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.26 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  34.34 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  40.76 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  35.47 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  37.18 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36.18 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  34.19 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  33.83 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  34.9 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  43.1 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  31.23 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  36.98 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  35.39 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  33.72 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  34.19 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.96 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  36.15 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  36.76 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.59 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  32.59 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  32.59 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  31.85 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  32.22 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  32.22 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.32 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  34.82 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  34.82 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  31.11 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.87 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  31.84 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.11 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  36.03 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  34.71 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  31.85 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  32.5 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  34.3 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  37.86 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  37.4 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.13 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.13 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  32.52 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.13 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  35.42 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.71 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.71 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  34.98 
 
 		 233 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  36.65 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.25 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  36.19 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  34.44 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  36.93 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  33.88 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  33.89 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  35.91 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  36.69 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.48 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  37.04 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.1 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  35 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.03 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  30.51 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  34.69 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  33.58 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  35.38 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>