More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3173 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  66.79 
 
 		 264 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  64.5 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  61.45 
 
 		 264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  60.38 
 
 		 283 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  60.38 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  60 
 
 		 265 aa  309  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  59.69 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  61.83 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  61.57 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  61.41 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  60.66 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  60.49 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  60.17 
 
 		 255 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  60.49 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  58.92 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  57.25 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  60.08 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  56.69 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  59.92 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  54.37 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  48.26 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  54.51 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  53.52 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  54.94 
 
 		 256 aa  258  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  57.26 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.46 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  52.44 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  51.17 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  53.73 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  52.07 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  56.72 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  56.9 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  53.53 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  50.81 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  52.26 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  41.26 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  48.82 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  51.03 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  46.91 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.41 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.03 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  37.45 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.38 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.15 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.19 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.93 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.81 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.44 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.36 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  35.18 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.6 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.6 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.6 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  33.21 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.6 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.01 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  37.19 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  35.29 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  36.55 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.68 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.67 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  35.86 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.78 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.01 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1792  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  39.26 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  36.63 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.19 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36.02 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  37.11 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  34.51 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.95 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  36.72 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  37.08 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.65 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  34.86 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  36.6 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  31.8 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.02 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>