More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2494 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  55.69 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  53.04 
 
 		 272 aa  261  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  52.7 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  50.4 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  48.78 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  42.11 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  40.41 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  42.35 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  42.35 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  40.39 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  40.17 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  40.39 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  39.22 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  39.66 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  40.39 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.04 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.21 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  35.55 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  34.8 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  35.92 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.75 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.86 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  35.12 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  35.06 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  32.3 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  34.51 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  35.18 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  36.95 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  32.79 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  33.75 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  34.78 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  32.64 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.6 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.95 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.42 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.17 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  34.13 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  35.15 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  36.17 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.2 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  33.2 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  32.94 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  29.74 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  32.02 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  34.58 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.37 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  30.35 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  36.32 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.35 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  33.74 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  34.89 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  31.89 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.98 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  33.99 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.14 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  30.62 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  33.19 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  29.53 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  34.38 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  33.07 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  31.75 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  36.29 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  31.75 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  34.25 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  31.75 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  31.75 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  31.52 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  34.65 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.84 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  31.16 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.14 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>