More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1061 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  54 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2619  hypothetical protein  56.43 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0794  protein of unknown function DUF152  53.44 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2317  protein of unknown function DUF152  52.63 
 
 		 277 aa  248  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0693  protein of unknown function DUF152  53.33 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0819633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  40.79 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  38.86 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  40.79 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.67 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  34.71 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  36.25 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.83 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.25 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  40.35 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  33.6 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  32.69 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  33.76 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  33.86 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  33.6 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  32.21 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  32.31 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  32.79 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  33.6 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  34.19 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  30.55 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  33.74 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.47 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  32.66 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  32.64 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  34.39 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  33.85 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  32.65 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  36.44 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  31.85 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  30.18 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  32.92 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.66 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  31.98 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  32.94 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  37.19 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  35.61 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  34.3 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  34.13 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  34.21 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  31.62 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  31.56 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  34.63 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  32.16 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  31.32 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  31.51 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  31.52 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  32.52 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  32.52 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  32.05 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  34.43 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  31.73 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  32.37 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  30.92 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  36.8 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  31.69 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  34.31 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  33.73 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  32.1 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  32.92 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  31.66 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  36.8 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  34.15 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  30.51 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  35.57 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  31.69 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  32.43 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  30.9 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  31.17 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.01 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  32.08 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  33.04 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6287  hypothetical protein  32.05 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  34.35 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1792  hypothetical protein  32.05 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>