More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2089 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  50.61 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  48.87 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  51.19 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3598  hypothetical protein  48.69 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0957834  normal  0.104911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  47.94 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  45.86 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  48.13 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  45.86 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  48.3 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  46.67 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  47.01 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  47.18 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  47.18 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  47.18 
 
 		 243 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  51.6 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  47.08 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  45.63 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3820  hypothetical protein  45.96 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0511811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2137  hypothetical protein  46.98 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  45.88 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  47.62 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  46.24 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  44.4 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  44.4 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  44.4 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  44.4 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  44.4 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  39.55 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  44.4 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  44.4 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  41.9 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  43.2 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  42.74 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  42.74 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  43.85 
 
 		 232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  47.77 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  45.49 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  41.25 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  47.56 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  41.11 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  40.65 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  44.72 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  43.72 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  42.19 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  42.91 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  46.79 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  44.62 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6287  hypothetical protein  46.62 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1792  hypothetical protein  46.62 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  42.08 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  44.08 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  42.8 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  45.2 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  45.25 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  45.02 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  45.28 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  39.45 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  43.72 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  41.7 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  43.2 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  43.07 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  41.73 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  43.45 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  41.18 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  41.18 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  42.69 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  40.08 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  41.18 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  41.18 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  42.02 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  41.34 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  42.02 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0498  hypothetical protein  44.94 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.75 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  40.78 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  38.11 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  41.34 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  40.78 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  40.78 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2254  hypothetical protein  42.96 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0355763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  40.94 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  40.77 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  36.82 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  40.89 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  42.17 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.21 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  40.7 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  40.39 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  37.9 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  46.34 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  40.94 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  36.12 
 
 		 242 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  40.38 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  42.62 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  39.92 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  42 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>