More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2619 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2619  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2317  protein of unknown function DUF152  71.54 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0794  protein of unknown function DUF152  59.6 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  61.11 
 
 
253 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  56.43 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0693  protein of unknown function DUF152  54.07 
 
 
245 aa  255  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0819633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  40.09 
 
 
256 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  40.69 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 
252 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  39.83 
 
 
252 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  42.07 
 
 
315 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.57 
 
 
242 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  40.69 
 
 
259 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.86 
 
 
243 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  33.72 
 
 
262 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  36.26 
 
 
285 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.5 
 
 
262 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.77 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.89 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.86 
 
 
243 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.01 
 
 
248 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.86 
 
 
243 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  32.67 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  32.82 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.44 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  32.94 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.79 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  33.06 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  37.85 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.65 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  31.25 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  37.3 
 
 
246 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  35.02 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  35.02 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  33.6 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  35.22 
 
 
261 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  32.81 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  36.08 
 
 
250 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  35.89 
 
 
246 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  36.86 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  33.2 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  34.9 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  33.47 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  33.58 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  34.6 
 
 
243 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  35.18 
 
 
243 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.87 
 
 
232 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  31.2 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  37.74 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  36 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  33.2 
 
 
247 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  33.86 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  33.99 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  34.73 
 
 
277 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  34.98 
 
 
239 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  36.23 
 
 
268 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  34.25 
 
 
249 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  32.54 
 
 
275 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  34.12 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  31.23 
 
 
268 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  34.12 
 
 
242 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  33.73 
 
 
240 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  32.4 
 
 
265 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  32.4 
 
 
283 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  36.9 
 
 
255 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  35.74 
 
 
242 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  37.84 
 
 
260 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.5 
 
 
268 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  34.13 
 
 
244 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  37.84 
 
 
260 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  33.47 
 
 
264 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  32.49 
 
 
253 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  32.95 
 
 
266 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  32.95 
 
 
278 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  33.62 
 
 
272 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  31.42 
 
 
254 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  34.59 
 
 
263 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 
244 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  34.75 
 
 
240 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  32.17 
 
 
275 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  31.02 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>