More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2852 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  40.38 
 
 
256 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  36.45 
 
 
273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.76 
 
 
279 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  35.2 
 
 
268 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  30.38 
 
 
272 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  32.89 
 
 
252 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  30.63 
 
 
275 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  33.23 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  27.16 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  33.22 
 
 
252 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2619  hypothetical protein  42.07 
 
 
251 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  31 
 
 
270 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0326  hypothetical protein  40.97 
 
 
243 aa  123  5e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  30.25 
 
 
267 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  31.86 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  29.81 
 
 
267 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2317  protein of unknown function DUF152  31.94 
 
 
277 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  29.59 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  28.62 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  31.16 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  28.72 
 
 
264 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  31.95 
 
 
274 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  38.65 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  30.36 
 
 
275 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0794  protein of unknown function DUF152  36.6 
 
 
252 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  29.59 
 
 
253 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  28.67 
 
 
265 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  27.24 
 
 
268 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  27.05 
 
 
224 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  27.03 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.51 
 
 
263 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0693  protein of unknown function DUF152  38.56 
 
 
245 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0819633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  30.75 
 
 
272 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  38.16 
 
 
259 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  35 
 
 
240 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  38.36 
 
 
259 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  28.04 
 
 
271 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  36.48 
 
 
256 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 
256 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  36.81 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  30.72 
 
 
244 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  26.62 
 
 
256 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  34.81 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  28.53 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  27.27 
 
 
253 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  32.05 
 
 
255 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1240  protein of unknown function DUF152  29.75 
 
 
237 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  35.75 
 
 
262 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  28.35 
 
 
276 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  28.34 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  26.25 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.78 
 
 
266 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  30.17 
 
 
268 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  32.32 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  32.92 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  28.99 
 
 
255 aa  89  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  30.93 
 
 
252 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.13 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  35.93 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  34.16 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  31.68 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  28.39 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  33.54 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  27.68 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  32.75 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  28.99 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  28.9 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  28.22 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  27.18 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  30.07 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  26.8 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  26.94 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  26.06 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  26.94 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  29.19 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  29.18 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  27.46 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  30.07 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  29.76 
 
 
269 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  27.85 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  28 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  28.48 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  32.91 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  26.45 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  29.39 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  37.91 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  26.78 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0279  hypothetical protein  31.33 
 
 
230 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.300917  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  29.41 
 
 
274 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  26.44 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  26.23 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  28.86 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  31.87 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  31.71 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  31.1 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>