More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1488 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  498  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  50.88 
 
 
252 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  48.9 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  48.67 
 
 
252 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09450  hypothetical protein  36.1 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000208595  normal  0.0474468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  45.22 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.48 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  40.54 
 
 
253 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.87 
 
 
273 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  37.14 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  33.47 
 
 
282 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  32.94 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  36.17 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  37.79 
 
 
227 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  40.08 
 
 
262 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  37.92 
 
 
259 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  36.32 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2137  hypothetical protein  36.12 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.93 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  32.1 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.51 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08900  hypothetical protein  35.92 
 
 
280 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000429341  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  39.29 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  35.48 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  36.9 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  36.17 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  31.02 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  31.02 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  32.6 
 
 
249 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  36.56 
 
 
244 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  32.95 
 
 
276 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  36.25 
 
 
248 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  35.77 
 
 
265 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.35 
 
 
267 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 
254 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  35.97 
 
 
254 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.47 
 
 
293 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  39.35 
 
 
247 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  33.19 
 
 
283 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.19 
 
 
265 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.75 
 
 
244 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  32.11 
 
 
275 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  35.46 
 
 
254 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.43 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  37.96 
 
 
250 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.46 
 
 
274 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  35.69 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  29.76 
 
 
234 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  38.33 
 
 
271 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  31.98 
 
 
253 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  36.51 
 
 
255 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.57 
 
 
285 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  36.29 
 
 
255 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.5 
 
 
242 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  28.52 
 
 
272 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.52 
 
 
272 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  34.85 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.28 
 
 
268 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  33.47 
 
 
275 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  35.27 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.02 
 
 
241 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.69 
 
 
264 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  29.76 
 
 
234 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.04 
 
 
251 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.43 
 
 
234 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.55 
 
 
264 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  40 
 
 
241 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.47 
 
 
246 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.23 
 
 
224 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.63 
 
 
272 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  28.52 
 
 
272 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.95 
 
 
266 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  33.18 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.85 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.33 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  35.74 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  34.98 
 
 
242 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  34.47 
 
 
246 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  35.32 
 
 
264 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  35.74 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  37.95 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  38.07 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  37.78 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  28.12 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  28.12 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.12 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.83 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  32.91 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  31.74 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  35.55 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  33.91 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>