More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2510 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  52.03 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  52.7 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  50.41 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  48.37 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  51.03 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  48.77 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  44.4 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  40.57 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.51 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  36.47 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  39.75 
 
 		 267 aa  161  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  37.97 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.83 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.24 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  38.33 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.12 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.11 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  38.37 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  37.39 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  34.84 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.39 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  35.12 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.98 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  33.73 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  35.51 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.87 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.03 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  37 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  37.99 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.58 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  35.47 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  34.6 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  35.04 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.78 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.71 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  36.44 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.04 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  35.42 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  35.29 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  36.56 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  33.88 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  34.58 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  32.68 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  36.12 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  31.49 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.62 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  34.3 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  35.02 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  34.8 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.25 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.17 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.51 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  33.75 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  33.75 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  30.8 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  35.29 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  34.32 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  34.91 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  30.35 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  33.76 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  32.35 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  33.75 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  34.89 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  36.71 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.4 
 
 		 299 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  35.42 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  33.73 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  32.92 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  34.16 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  34.75 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>