More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0015 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  44.86 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  42.53 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  40.49 
 
 
273 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  40.73 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  38.64 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  41.87 
 
 
268 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.12 
 
 
268 aa  191  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  38.96 
 
 
275 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  35.42 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.29 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  37.7 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  37.87 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  35.29 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  35.32 
 
 
272 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  35.32 
 
 
272 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  34.33 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  34.33 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.33 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  38.84 
 
 
272 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.32 
 
 
272 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  34.94 
 
 
272 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  37.16 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  34.83 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  36.78 
 
 
275 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  34.66 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.92 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  37.55 
 
 
267 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  36.21 
 
 
248 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.78 
 
 
264 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.78 
 
 
264 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  36.25 
 
 
260 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.82 
 
 
252 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  35.95 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  36.07 
 
 
267 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 
252 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  36.55 
 
 
259 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  37.6 
 
 
255 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.98 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35.39 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  37.05 
 
 
256 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  35.98 
 
 
253 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  36.11 
 
 
282 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  32.92 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09450  hypothetical protein  34.25 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000208595  normal  0.0474468 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.11 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  35.02 
 
 
262 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  35.37 
 
 
255 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  36.75 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.84 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.8 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  34.96 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  33.75 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  34.5 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  34.76 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  32.64 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  34.55 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  34.69 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  32.94 
 
 
243 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  31.91 
 
 
263 aa  125  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  32.79 
 
 
254 aa  125  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  34.52 
 
 
255 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  32.55 
 
 
243 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  32.95 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  32.37 
 
 
224 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  32.55 
 
 
243 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  34.04 
 
 
276 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  33.06 
 
 
254 aa  122  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  32.95 
 
 
243 aa  121  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.2 
 
 
234 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  34.16 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  32.78 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  32.38 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  29.72 
 
 
263 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.46 
 
 
256 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
238 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  30.2 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  29.59 
 
 
315 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  32.05 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.72 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1246  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000369455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>